週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
9/7 |
次世代定序在分子生物學上的應用簡介與原理
上課地點為 生科館 419電腦教室 |
第2週 |
9/14 |
RNA-seq /ChIP-seq原理與應用工具
期末報告摘要範例 |
第3週 |
9/21 |
1. 介紹Linux command & send jobs
2. 決定報告時間
3. 申請iService和國網主機帳號
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第4週 |
9/28 |
請演講1-Linux 系統與國網使用--國網中心黃介瑋 於生科館419電腦教室上課 |
第5週 |
10/5 |
1. 國網使用練習/Unix系統 送job實作練習: 下載SRA files
2. Sequence alignment ---(RNA-seq analysis 1) |
第6週 |
10/12 |
HTSeq-count 和 Differential expressed gene 分析 ---(RNA-seq analysis 2) |
第7週 |
10/19 |
邀請演講2--中研分生所 nanopore sequencing analysis
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第8週 |
10/26 |
R 工具的應用與實作—heatmap, PCA, GSEA ---(RNA-seq analysis 3) |
第9週 |
11/2 |
網路資源應用: IGV, GO (DAVID genome), UCSC |
第10週 |
11/9 |
文獻討論1---學生報告NGS應用之技術
---繳交期末報告計畫摘要--- |
第11週 |
11/16 |
文獻討論2---學生報告NGS應用之技術
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第12週 |
11/23 |
文獻討論3---學生報告NGS應用之技術
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第13週 |
11/30 |
個案討論報告與實作 |
第14週 |
12/7 |
個案討論報告與實作
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第15週 |
12/14 |
個案討論報告與實作
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第16週 |
12/21 |
個案討論報告與實作
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